3MATP荧光检测仪的工作原理基于ATP（三磷酸腺苷）的存在，因为所有活细胞都需要ATP来进行能量代谢。当细胞死亡时，细胞膜破裂，内部的ATP会释放到周围环境中。通过测量这些释放出的ATP，可以间接地反映出样品中微生物的数量和活性。

操作3MATP荧光检测仪通常包括以下几个步骤：首先，从待测样品中提取出一定量的液体；然后，向液体中加入荧光素酶和荧光素；接着，将混合物放入检测仪中进行反应；最后，通过仪器读取产生的荧光信号强度，从而计算出ATP的浓度。

为了确保检测结果的准确性，操作人员需要注意以下几点：一是避免样品受到污染；二是正确处理和储存试剂；三是严格按照说明书进行操作；四是定期对仪器进行校准和维护。

3MATP荧光检测仪的优点在于其高灵敏度、快速响应和操作简便性。它可以在短时间内提供可靠的结果，而且不需要复杂的样品前处理过程。此外，由于其非侵入性和非破坏性的特点，它还可以在不干扰样品的情况下进行连续监测。

然而，3MATP荧光检测仪也存在一些局限性。例如，它不能区分活细胞和死细胞中的ATP；在某些情况下，非生物物质也可能产生假阳性结果；此外，对于某些特定类型的微生物，可能需要特殊的处理方法才能有效检测。