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（1）乡镇生活污水处理缺乏污水收集和处理设施，污水直排。我国95%以上村庄和90%以上的小集镇都没有完善的污水收集和处理设施，产生的生活污水和部分工业废水，几乎是未经任何处理直接排入乡镇的水体（河道、池塘、地下水等），造成乡镇水体的严重污染。乡镇缺乏污水处理收集设备致使乡镇生活污水处理形同虚设。
       （2）水体污染严重。由于污水直接排入水体，加之乡镇水体通常较小，地区水体的流动性也较小，环境容量十分有限，造成的结果就是不但水体丧失了应有的功能，而其还严重破坏了乡镇的整体环境和景观。黑臭河道、池塘和富营养化的湖泊已成为普遍现象。
       （3）水环境污染和破坏还会产生连带污染效应，影响健康。研究表明，许多疾病的发生都是与水环境休戚相关的。水体污染有可能促进一些恶性疾病的发生。

       （4）缺乏有针对性的适用污水处理技术。由于乡镇污水具有排水量小儿分散、水质波动比较大等特点，以及与城市相比，乡镇在社会、经济和技术等条件上的差异，在乡镇污水处理上不宜采用较为成熟的城市污水工艺，而一些所谓的生态型工艺往往不能满足处理要求，或缺乏实施的条件(如土地资源)。而应采用一些工艺简洁、处理效果好，占地省、能耗低、运行管理简便、二次污染少的适用技术，采用分散式方式进行处理。